Flujo marrón al dejar anticonceptivas

Buenas tardes, quería hacer una consulta. Estuve siete años tomando pastillas anticonceptivas . Fui a la ginecóloga para comentarle que quería dejarlas y que me quería quedar embarazada me mandó femibión y me dijo que estaba todo bien en mi citología, mamografía y demás …que no me agobiara si la regla no me bajaba bien al principio y que hasta el año o así de estar buscando embarazo no tengo que preocuparme. Las dejé hace dos meses , la regla se me retrasa unos diítas pero bien… es este mes cuando ya hemos empezado a buscar lo que pasa es que no pudo ser en mis días fértiles entonces creo que no es posible que esté embarazada… ya que lo hicimos el dia 22 de mi ciclo, pero bueno el caso es que unos 5 días antes de que me baje la regla, mancho marrón ,solo a limpiarme y leo por ahí que eso es causa de alguna hormona que está descompensada pero claro no sé si volver a la ginecóloga y comentárselo o esperar… esto también me pasó el mes pasado. Luego como digo, la regla me bajó normal, eso sí, me duró poquitos días, creo que 3.
Comentar, ya que no sé si tendrá algo que ver, que tengo hipertiroidismo pero ahora mismo controlado con pastillas.
Que conejos me dais? Sé que no tengo que agobiarme y que esto viene cuando viene pero si es algo lo que me impide quedarme embarazada por alguna hormona cuanto antes poner solución mejor, pero tampoco quiero parecer una loca e ir corriendo a la gine ….Gracias