La práctica clínica habitual consiste en la transferencia de un único embrión (SET por sus siglas en inglés) en el día 5 de desarrollo embrionario, cuando ha alcanzado el estadio de blastocisto. Se recomienda priorizar esta estrategia frente a la transferencia de embriones de día 3 (estadio de células) porque el blastocisto tiene un mayor potencial de implantación y mejor sincronización entre su estado de desarrollo y la receptividad del endometrio, lo que se traduce en tasas de embarazo significativamente más altas. Además, la transferencia electiva de un único embrión minimiza el riesgo de embarazo múltiple, que puede conllevar complicaciones tanto para la madre como para los bebés.

Algunos estudios han postulado que la transferencia secuencial de embriones, que consiste en la transferencia de un embrión en el día 3 y un blastocisto en el día 5 del mismo ciclo, puede mejorar los resultados reproductivos en base a diversos mecanismos fisiopatológicos:
- Aumentando la probabilidad de alcanzar la ventana de implantación: al transferir embriones en diferentes estadios de desarrollo se incrementa la posibilidad de que, al menos uno, implante exitosamente aprovechando el momento de receptividad óptima del endometrio.
- Modulando la respuesta inmune: es posible que el embrión de D3 transferido más temprano comience a generar tolerancia inmunitaria en el útero y proporcione un mejor entorno endometrial para la transferencia del embrión de D5.
En la actualidad, disponemos de pruebas diagnósticas para evaluar tanto la ventana de implantación como la tolerancia inmunitaria endometrial y optimizar, en base a sus resultados, el momento y las condiciones óptimas para la transferencia de embriones.
En cuanto a los embriones con un desarrollo más lento, que alcanzan el estadio de blastocisto en D6, la literatura existente sugiere que la mejor estrategia es la criopreservación de todos ellos para transferirlos en un ciclo posterior. Se ha observado una tasa de nacido vivo significativamente mayor en las criotransferencias de embriones D6 en comparación con las transferencias en fresco. Esto se debe a que la estimulación ovárica controlada durante el ciclo en fresco puede adelantar el desarrollo endometrial llevando a una asincronía entre la receptividad del endometrio y el desarrollo de los embriones con cinética más lenta.
