Retraso menstrual, relación con protección, dolores, flujo marrón y transparente

Hola, soy nuevo en este foro y me anime a entrar ya que tengo una gran preocupación.

Lo que pasa es que mi novia y yo tuvimos relaciones con protección el día 22 de su periodo (siempre con protección), no hubo penetración sin el preservativo, cuando eyacule lo hice fuera con el preservativo puesto, no se recorrio ni nada y despues lo revise llenándolo con agua y todo estaba bien.

El problema es que ha tenido un retraso menstrual, en promedio sus periodos duran 29 días con los últimos de 27, 31 y 30 días respectivamente. Me ha contado que tiene dolores como cuando la regla le va a llegar pero no le llega, el dia 36 desde su anterior período (dia 14 despues de haber tenido relaciones) le bajo un pequeño flujo marron que manchó su toalla (me contó) y los dolores siguen pero aun nada.

El dia 16 despues de haber tenido relaciones hicimos una prueba de embarazo de orina y salio negativa.

Ya es el dia 18 y me dijo que le ha solo salido flujo transparente y le acaba de llegar un cólico algo fuerte apenas hoy.

Nota: Esto ya habia ocurrido anteriormente hace 6 meses, cuando tuvimos relaciones con condon y tuvo un periodo de 35 días con el anterior a ese de 32 días y los anteriores de 28, esa vez igual tardo en bajarle la regla con dolores y cólicos, y despues de un rato bajo primero un flujo marron tambien y despues de ello ya le bajo los días que deben.

PODRIA SER EMBARAZO? Estoy algo preocupado, ya que no está en nuestros planes por ahora.

Por cierto, cabe mencionar que en su periodo pasado, tuvo una infección posiblemente por hongos, teniendo flujo blanquecino y se le quito utilizando medicamento de óvulos. No se si esto podría explicar algo.